Utilitaires pour EcoFoG

Source: vignettes/EcoFoG.Rmd

Contenu du package

Ce package contient des outils utiles aux membres de l’UMR. Il est hébergé sur GitHub sans vocation à être déposé sur CRAN.

Il contient :

  • Des modèles de documents RMarkdown:

    • Un modèle d’article (produit au format PDF) bien formaté;
    • Un modèle de mémo (produit au format PDF) plus simple que l’article;
    • Un modèle de présentation Beamer;
    • Un modèle d’ouvrage (Bookdown): livre, rapport, thèse.

  • Du code :

    • Des fonctions pour accéder aux données de la base Guyafor à partir du réseau local du campus de Kourou ou en VPN.

Modèles de documents

Dans RStudio, créer un nouveau document de type Document R Markdown. L’assistant permet de choisir entre divers formats.

Cliquer sur From template: à partir de modèles installés par des packages. Les modèles du package EcoFoG sont affichés.

Ecrire le document dans RStudio : le mode d’emploi des modèles est dans leur contenu.

Cliquer sur le bouton Knit de RStudio génère le document au format demandé.

Il est préférable de créer un projet RStudio pour bénéficier de toutes les possibilités : File / New Project puis utiliser l’assistant pour créer un projet à partir d’un dossier existant.

Voir la documentation détaillée.

AutoMap

Application Shiny pour la création de cartes de Paracou.

Exécuter Automap() et compléter le formulaire pour obtenir une carte.

L’application ne fonctionne que si elle peut accéder à la base de données Guyafor, ou à une copie locale.

Accès aux données

Les fonctions Guyafor2df() et Paracou2df() produisent des dataframes à partir de la base de données Guyafor.

Documentation complète

https://EcoFoG.github.io/EcoFoG/